Consultoría Jurídica: Como instancia de Asesoría Jurídica, es la unidad institucional que integra armónicamente todas las directrices y criterios legales que rigen la gestión del Instituto con los cambios constitucionales y legales que ocurren en el país.

Tiene como objetivo fundamental: emitir dictámenes jurídicos orientados por principios constitucionales que coadyuven a la consolidación de una sociedad democrática, participativa y protagónica, en un estado social de derecho y de justicia que afiance los valores de la libertad, la independencia, la paz, la solidaridad, el bien común, la integridad territorial, la convivencia y el imperio de la ley.

Gerencia de Auditoria Interna: Es el órgano de control fiscal del ICLAM, adscrito a la máxima autoridad del mismo, con autonomía funcional, cuyo objetivo principal es el control, la vigilancia y fiscalización de  los  ingresos,  gastos  y  bienes  del  organismo;   además de contribuir a elevar los niveles de eficacia, eficiencia, economía, calidad e impacto de la gestión del ICLAM al servicio de la colectividad.

Oficina de Planificación y Presupuesto: Es una Unidad de asesoría y evaluación técnica, encargada de la formulación, modificación, seguimiento y control de los planes y del presupuesto institucional, en correspondencia con los objetivos de la organización,  las demandas del entorno y la  normativa legal  establecida, con relación a la materia.

Gerencia de Administración y Servicios: Garantiza la eficiencia y transparencia de la gestión administrativa institucional, en correspondencia con las normas y procedimientos que rigen la materia, establecidas por la Administración Pública Nacional (APN). 

Su visión es, optimizar los resultados de la gestión administrativa del instituto, a través de la integración de los diferentes subsistemas. 

Cuenta con tres divisiones: Personal, Servicios Generales y Administración Financiera.